по крайне мере нам не показали чтобы нарутка что-то юзал на кагую, а кагуя юзала только шипы которыми и слила его

осталось за кадром

это уже имхо, такое же как и с тобирамой, ибо неизвестно как именно Мадара его слил

смотри по сканам, шипы были заюзаны в первый раз сразу после того как Кагуя выкинула Саске. Когда нам показывают команду и клона, Саске уже выкинут. Они там пообщаться успели, побегать поискать Наруто и по пути рассказать Обито что тут происходит. Не думаю что за все это время все что успела сделать Кагуя это заюзать один раз шипы, если б это был бы тот же момент то она по идее раз 50 шотнуть Наруто должна была успеть пока они там болтают и ищут.

так может быть он отбивался от этих шипов? а кагуя их юзала по кд?

аруто говорит, что юзать мегамощные техники бессмысленно, ведь Кагуя их тупо поглотит, и нужно юзать Тай.