Оно условное и есть. В манге нигде и никогда не было ни одного упоминания о разных покровах у Эя. В бою с Саске, как ты и заметил, он ускорялся постепенно. И для защиты от Аматерасу, он накопил больше чакры для применения шуншина. Т.е. его скорость в покрове не изменилась. Увеличение чакры увеличило его реакцию, что позволяло реагировать на аму и применять вовремя шуншин.